Train to the End of the World. Kehadiran teknologi Jaringan 7G menjanjikan kemajuan teknologi yang menakjubkan; namun, setelah perilisannya, Jepang mengalami kekacauan. Dari perubahan drastis yang terjadi pada lingkungan sampai mutasi yang aneh di antara orang-orang, cara hidup ditimpa oleh aturan-aturan baru. Kota Agano adalah salah satu dari sedikit pemukiman yang tersisa, dan warganya yang berusia 21 tahun ke atas telah berubah menjadi hewan.
Shizuru Chikura, seorang murid SMA dari Agano, putus asa mencari temannya, Youka Nakatomi. Saat menemukan sebuah gambar di koran yang memperlihatkan Youka berada di Ikebukuro, Shizuru mulai berkemas untuk merencanakan pencariannya. Namun, dengan transportasi umum yang ditutup secara permanen, pilihannya menjadi terbatas. Untungnya, Tairo Zenjirou, seorang kondektur tua yang sudah pikun dan satu-satunya orang dewasa di kota itu, datang untuk menyelamatkannya dengan mengajarinya cara mengoperasikan kereta yang ditinggalkan.
Dengan tujuan yang sudah ditentukan, Shizuru memulai perjalanan untuk menemukan temannya yang hilang. Namun, pada hari keberangkatan, teman-teman sekelasnya yang lain-Nadeshiko Hoshi, Reimi Kuga, dan Akira Shinonome-memutuskan untuk ikut serta pada menit-menit terakhir saat mereka memulai petualangan satu jalur yang mungkin akan menghadapkan mereka pada bahaya yang jauh melebihi apa pun yang pernah mereka temui di Agano.