Jougorou Kobato memiliki kebiasaan untuk melibatkan dirinya ke dalam masalah orang lain. Setelah menyadari bahwa kemampuan detektifnya tidak diinginkan atau dihargai, dia membuat kesepakatan dengan temannya yang pemalu, Yuki Osanai, untuk menjadi orang biasa bersama-sama. Kini saat memasuki SMA, mereka ingin dianggap sebagai orang biasa, namun Kobato tidak bisa menahan diri untuk kembali ke kebiasaan detektifnya ketika dihadapkan dengan misteri sehari-hari.
Sayangnya, tidak semua kejadian normal yang mereka temui. Ketika mereka menjalani hari-hari sekolah mereka dengan berusaha untuk tidak menarik perhatian, Kobato dan Osanai terkadang terjebak dalam insiden yang membuat rencana mereka untuk menjalani kehidupan yang damai dan biasa-biasa saja menjadi beresiko.
