Takashi Natsume telah terbiasa dengan pertemuannya dengan para youkai melalui Buku Teman, yang berisi nama-nama youkai yang telah disegel oleh neneknya, Reiko Natsume, dalam sebuah kontrak. Pertemuan-pertemuan ini memungkinkan Natsume untuk lebih memahami para youkai, Reiko, dan dirinya sendiri.
Buku Teman adalah alat yang ampuh yang dapat digunakan untuk mengendalikan youkai; buku ini dicari oleh para youkai dan pengusir setan. Natsume hanya ingin menjalani kehidupan sehari-harinya dengan tenang, tetapi selalu terganggu oleh pengalaman ini. Jika dia ingin mengakhiri siksaan ini, Natsume harus mengeksplorasi lebih lanjut tentang buku dan dunia pengusiran setan, serta mulai membuka hatinya kepada mereka yang dapat membantunya.
